JetBrains から、InteliIJ IDEA 2019.1 が先月リリースされました。

前回の設定を引き継ぐを選択したのに、設定が反映されなかった場合、
一回、以下ディレクトリを削除してみると、再度初回起動のように選択ダイアログが表示されます。

https://www.jetbrains.com/help/pycharm/directories-used-by-the-ide-to-store-settings-caches-plugins-and-logs.html

rm -rf ~/Library/Preferences/IntelliJIdea2019.1
rm -rf ~/Library/Caches/IntelliJIdea2019.1

設定適用に時間がかかるようで、途中で終了したのが駄目だったようです。
おとなしく待っていれば正しく適用されていました。

とはいえ、15分以上かかったので
プラグインのダウンロードとかいろいろ裏でやってそうですね。
進捗が見えないのでちょっと判りにくかったです。